商品庫存發生溢缺時，應先用“待處理財產損失溢余”科目核算。

1、當盈余以買價入賬時，借記庫存商品，貸記待處理財產損失和溢余；

2、采用商品價格核算的，借記庫存商品，貸記待處理財產，商品購銷差價，報部批準后，作為減少營業外支出。借記待處理財產的損失和溢余，貸記業務費用；

3、短缺商品以進價核算，借記待處理財產損失，貸記庫存商品；

4.對于以售價入賬的商品，借記待處理財產的損耗和溢余，借記商品購銷差價，貸記庫存商品。查明原因后，分別處理，應由保險公司或其他過失人賠償的損失，借記其他應收款，貸記待處理財產的損失溢余；自然災害造成的損失，扣除殘值和保險公司賠償后的凈損失，借記營業外支出，貸記待處理財產的損失溢余；對于無法收回的其他損失，借記管理費，貸記待處理財產的盈余。