水利基金是指經濟管理部門對于水利資源的開發和管理所征收的一種費用，用于補充國家水利基金的收入。上繳水利基金是指企業將自身應繳的水利基金計入費用并做出詳細的會計分錄，以便記錄和核算該項支出。

上繳水利基金通常包括兩個方面的費用，分別是基本水資源費和水資源補償費。基本水資源費用于強調水資源的公共性質，補償水資源占用者的合理需求；而水資源補償費用于補償水資源開發利用者對資源和生態環境的破壞。

以某企業為例，假設該企業需要上繳水利基金1000元。

1. 上繳基本水資源費的會計分錄：

借：水利基金支出（費用類科目） 1000元

貸：應付基本水資源費 1000元

2. 上繳水資源補償費的會計分錄：

借：水利基金支出（費用類科目） 1000元

貸：應付水資源補償費 1000元

這些會計分錄將記錄水利基金的支出，并相應地在負債類科目中增加應付的水利基金。

當企業實際支付水利基金時，會計分錄應為：

借：應付基本水資源費（或應付水資源補償費） 1000元

貸：銀行存款 1000元

這樣就將應付的水利基金從負債類科目中清除，并記入銀行存款。

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